公積金貸款在扣除借款人公積金余額時，通常會在借款人的賬戶中直接劃扣一定額度的公積金作為首付或直接用于償還貸款。這種操作方式主要取決于當?shù)刈》抗e金管理中心的具體政策和借款人的實際情況。

以某地的一位李女士為例，她打算通過公積金貸款購買一套總價為200萬元的房產(chǎn)。根據(jù)當?shù)卣撸状钨彿靠梢陨暾堊罡?0%的貸款比例，即貸款額度為180萬元。考慮到李女士的公積金賬戶余額充足，達到50萬元，當?shù)毓e金管理中心決定從她的賬戶中直接扣除一部分資金用于支付首付，并將剩余的公積金余額作為月供的一部分來抵扣貸款本金和利息。

按照當?shù)卣撸e金貸款利率為4.0%，而商業(yè)貸款利率則為5.6%。由于公積金貸款利率較低，因此在同等條件下選擇公積金貸款更為劃算。假設李女士選擇了20年的貸款期限，那么每月的還款額會顯著低于商業(yè)貸款。具體計算如下：

1. 公積金貸款：月供約為9,077元（包括本金和利息），其中利息部分占較大比例。

2. 商業(yè)貸款：月供約為10,391元，同樣包括本金和利息，但利息部分更高。

通過對比可以看出，即使在扣除公積金余額的情況下，選擇公積金貸款仍然能夠有效降低月供負擔。如果李女士的公積金賬戶余額足夠多，甚至可以完全覆蓋首付款，從而實現(xiàn)“零首付”購房，這無疑對改善居民住房條件具有重要意義。

在實際操作過程中，不同地區(qū)對于公積金貸款的具體規(guī)定可能存在差異。例如，有些地方可能允許一次性提取全部公積金余額用于首付，而不將其納入貸款償還計劃；而在另一些地方，則可能會將公積金余額按比例分攤到整個貸款期間內，用于抵扣每月還款額。建議購房者在申請公積金貸款前，詳細了解所在地的具體政策和流程，以便做出最合適的財務規(guī)劃。

公積金貸款確實會扣除借款人的公積金余額，但這一過程旨在減輕購房者的經(jīng)濟壓力，提高其購房能力。通過合理利用公積金資源，不僅能夠享受更低的貸款利率，還能有效控制月供支出，實現(xiàn)更穩(wěn)健的財務規(guī)劃。